Новый метод по работе с ДНК был разработан недавно исследователями Колумбийского университета вместе со специалистами Нью-Йоркского Центра исследования генома. Эту технологию можно использовать в разных областях. Однако на первом месте стоят эксперименты с раковыми клетками: необходимо быстро и точно идентифицировать клеточные линии.
Учёные разработали новое программное обеспечение. Запускается оно на MinION — это прибор, предназначенный для втягивания нити ДНК сквозь микроскопические поры и считывания последовательности нуклеотидов. Размер его равен кредитной карте и стоит 1100$. Так как размер у устройства очень маленький и в использовании он прост, с помощью него можно исследовать бактерии и вирусы. Однако прибор имеет высокую частоту ошибок и низкую скорость, поэтому применять его в анализировании человеческих клеток ранее было нельзя.
В настоящее время учёные нашли выход. Они предложили беспроигрышный вариант: в режиме реального времени можно исследовать ДНК человека, при этом точность у MinION с новым программным обеспечением будет максимально высокой, почти идеальной. Наш геном получается уникальным за счёт того, что нуклеотиды варьируются между людьми, от человека к человеку. На них прибор и сосредотачивает своё внимание. После этого происходит сравнивание возникших сочетаний вариантов с другими возможными генетическими профилями.
Всё это течение называют процессом создания «генетического эскиза». Их база увеличивается с помощью наборов для домашнего тестирования. Пришлось воспроизвести от 60 до 300 пробных запусков, чтобы добиться наиболее точного определения людей по ДНК, время исследования также сократилось до нескольких минут. Например, на идентификацию автора проекта потребовалось всего несколько минут.
В первую очередь устройство планируют использовать при экспериментах с раковыми клетками, это и есть самая перспективная область, где могут пригодиться «генетические эскизы». Существуют данные, что около 30% выделяемых средств (из 28 миллиардов долларов) каждый год теряются из-за допущения ошибок в идентификации клеток. Обновлённое ПО поможет исправить ситуацию, сократив количество ошибок.
К распространению ДНК-тестов, используемых в домашних условиях, люди относятся по-разному. Учёные одобряют эту инициативу, поскольку идёт пополнение базы данных. А вот Сенатор США Чак Шумер настроен категорично против, поскольку переживает, что личные данные пациентов могут быть проданы третьим лицам. Но новый метод распознания человека по ДНК может оказаться полезен криминалистам, когда требуется быстрый и точный результат.
Источник: sciencedaily.com
